Flora Jay

Advisors

• Olivier François2011 · Université de Grenoble · doctoral

Students5

• Arnaud Quelin“Inferring the history of human populations using genomic polymorphism data : from approximate Bayesian computation to deep learning”2025 · Museum national d'histoire naturelle - MNHN PARIS · doctoral
• Antoine Szatkownik“Modélisation générative dans un espace latent et évaluation de données synthétiques en génomique des populations”2025 · Université Paris-Saclay · doctoral
• Clément Gain“Décalage génétique de population face aux changements environnementaux”2023 · Université Grenoble Alpes [2020-....] · doctoral
• Jérémy Guez“Cultural transmission of reproductive success: Causal mechanisms, genetic consequences, and machine-learning-based inference”2023 · Muséum national d'histoire naturelle · doctoral
• Théophile Sanchez“Reconstructing our past ˸ deep learning for population genetics”2022 · Université Paris-Saclay · doctoral

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• Olivier François

Theses1

• “Méthodes bayésiennes en génétique des populations : relations entre structure génétique des populations et environnement”2011 · Université de Grenoble · doctoral

  also named on this thesis

  • Florence Forbesjury president
  • Renaud Vitalisreferee
  • Michael Blumjury member
  • Etienne Kleinreferee
  • Stephanie Maneljury member
  • Bertrand Servinjury member

Sat beside the lineage

Theses where they were a committee member, examiner or in another role, not as advisor.

• Charlotte Claye“Concept-based interpretability of foundation models for medical research in immuno-inflammation”jury member · 2026 · Université Paris-Saclay · doctoral
• Alba Nieto Heredia“Demographic Inference in Structured Populations : Coupling Sequential Markovian Coalescence and Deep Learning”jury member · 2025 · Université Paris sciences et lettres · doctoral
• Gaspar Roy“An end-to-end transformer based approach for disease prediction from metagenomic data”jury member · 2025 · Sorbonne Université · doctoral
• Guillaume Lan-Fong“Deep learning for population genetics : inferring demography and targets of natural selection using convolutional neural networks”jury member · 2024 · Université de Lille · doctoral
• Margaux Lefebvre“Origine et évolution adaptative de deux agents du paludisme (Plasmodium falciparum et Plasmodium vivax) en Amérique latine”jury member · 2024 · Université de Montpellier · doctoral
• Luca Nesterenko“Apprentissage automatique pour l'évolution moléculaire”jury member · 2024 · Université Claude Bernard - Lyon I · doctoral
• Jeanne Trinquier“Data-driven generative modeling of protein sequence landscapes and beyond”jury member · 2023 · Sorbonne Université · doctoral
• Victoria Bourgeais“Interprétation de l'apprentissage profond pour la prédiction de phénotypes à partir de données d'expression de gènes”jury member · 2022 · Université Paris-Saclay · doctoral
• Elise Kerdoncuff“Méthodes d’inférence démographique récente utilisant les polymorphismes et leur liaison génétique”jury member · 2021 · Sorbonne Université · doctoral
• Romain Menegaux“Continuous embeddings for large-scale machine learning with DNA sequences”jury member · 2021 · Université Paris sciences et lettres · doctoral
• Etienne Routhier“Conception de séquences génomiques artificielles chez la levure par apprentissage profond”jury member · 2021 · Sorbonne Université · doctoral
• Kai Shimagaki“Advanced statistical modeling and variable selection for protein sequences”jury member · 2021 · Sorbonne Université · doctoral